目的 针对分离自内蒙古高原长爪沙鼠鼠疫自然疫源地的鼠疫耶尔森菌（鼠疫菌），进行DNA成簇的规律间隔短回文重复序列（CRISPR）分型，对比同一类型疫源地，不同地区分离的菌株基因型，建立沙鼠鼠疫疫源地鼠疫菌株的CRISPR基因库，为疫情的追溯和流行病学分析奠定基础。方法 应用3对CRISPR引物（YPa、YPb、YPc）将实验菌株DNA进行聚合酶链式反应（PCR）扩增并测序，然后将所测得CRISPR序列与文献最新报道的CRISPR Dictionary比对，找出CRISPR spacer阵列，确定基因型别，最后用Bionumerics 7.6软件制作聚类图，分析其进化关系。结果 33株鼠疫菌共发现9种spacer，包括4种YPa（a1、a2、a3、a56）、2种YPb（b1、b2）和3种YPc（c1、c2、c3），经比对所有菌株被归为1个CRISPR基因簇（Cb2），2个基因型，内蒙古自治区（内蒙古）鄂托克旗和杭锦后旗菌株为1个新基因型，命名为2'型（a1-a2-a3-a56，b1-b2，c1-c2-c3），内蒙古乌拉特前旗、河北省康保县和宁夏回族自治区银川市的菌株均为基因1型（a1-a2-a3，b1-b2，c1-c2-c3）。结论 鼠疫菌在内蒙古长爪沙鼠鼠疫疫源地整体上遗传稳定，归于1个基因簇，但是也存在一些微进化，体现在不同地区的菌株有不同的基因型。
王海峰, 陈永明, 周松, 牛艳芬, 杨晓燕, 张懿晖, 刘广, 杜国义, 刘合智, 史献明
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