鼠类感染淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒的RT-PCR检测与N基因序列分析

doi:10.11853/j.issn.1003.4692.2013.06.002

中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2013, Vol. 24 ›› Issue (6): 483-485.DOI: 10.11853/j.issn.1003.4692.2013.06.002

鼠类感染淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒的RT-PCR检测与N基因序列分析

胡群¹, 裘炯良², 马思杰¹, 马研¹, 李骏²

1 大榭出入境检验检疫局, 浙江宁波 315812;
2 宁波出入境检验检疫局

收稿日期:2013-07-09 出版日期:2013-12-20 发布日期:2013-12-20
作者简介:胡群（1977-），男，硕士，高级工程师，主要从事口岸病原学分子检测研究。Email：nbhuqun@sina.com
基金资助:
国家质检总局科技项目（2012IK233）；宁波市自然科学基金（2013A610240）

RT-PCR detection and N gene sequence analysis of Lymphocytic choriomeningitis virus in rodents

HU Qun¹, QIU Jiong-liang², MA Si-jie¹, MA Yan¹, LI Jun²

1 Daxie Exit-Entry Inspection and Quarantine Bureau, Ningbo 315812, Zhejiang Province, China;
2 Ningbo Exit-Entry Inspection and Quarantine Bureau

Received:2013-07-09 Online:2013-12-20 Published:2013-12-20
Supported by:
Supported by the Science Project of Administration of Quality Supervision, Inspection and Quarantine(No. 2012IK233)and the Natural Science Foundation of Ningbo(No. 2013A610240)

摘要/Abstract

摘要：

目的了解宁波市梅山口岸鼠类中淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）流行情况和基因序列特征。方法以LCMV N基因设计2对引物，采用RT-PCR方法对2012年宁波市梅山口岸捕获的鼠类样品进行LCMV检测，并对阳性样品的PCR产物进行测序及同源性和系统进化树分析。结果共检测53份鼠类样品，其中2份小家鼠样品为LCMV核酸阳性，分离的2株LCMV与国外LCMV分离株的同源性在75%～87%之间，与WHI株同源性最高（87%）并在系统发生树上属于同一组。结论证实当地鼠类中存在LCMV流行，新检测到的2株病毒与国外LCMV分离株存在一定差异。

关键词: 啮齿动物, 淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒, 反转录-聚合酶链反应, 序列分析

Abstract:

Objective To determine the prevalence and gene sequence of Lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) in the rodents in Ningbo Meishan Port Area. Methods Two pairs of specific primers were designed according to LCMV N gene, and RT-PCR was used to detect LCMV in the rodent samples captured in Ningbo Meishan Port Area in 2012. The PCR products of positive samples were subject to sequencing and then to nucleotide homology and phylogenetic tree analyses. Results Fifty-three rodent samples were tested, and two samples from house mice Mus musculus were LCMV-positive. The two isolated LCMV strains had a homology of 75%-87% with the LCMV strains isolated in other countries; they had the highest homology (87%) with the strain WHI and belong to the same group in the phylogenetic tree as the strain WHI. Conclusion LCMV prevalence in local rodents is confirmed, and there are some genetic differences between the two newly detected LCMV strains and the LCMV strains isolated elsewhere.

Key words: Rodent, Lymphocytic choriomeningitis virus, RT-PCR, Sequence analysis

中图分类号:

S443
R373

胡群, 裘炯良, 马思杰, 马研, 李骏. 鼠类感染淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒的RT-PCR检测与N基因序列分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2013, 24(6): 483-485.

HU Qun, QIU Jiong-liang, MA Si-jie, MA Yan, LI Jun. RT-PCR detection and N gene sequence analysis of Lymphocytic choriomeningitis virus in rodents[J]. Chines Journal of Vector Biology and Control, 2013, 24(6): 483-485.

[1]	刘郁桐, 刘雨杭, 袁道欢, 王宇杰, 秦姣, 王健, 陈鸿辉, 王英永, 陈再雄, 聂海燕, 刘全生. 广东韶关丹霞山国家级自然保护区内鼠种构成及分布调查分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2022, 33(1): 94-99.
[2]	李博, 崔燕, 刘遵季, 古丽阿依·包凯西, 罗勇军, 麦迪娜·肖开提, 王启果, 雒涛. 新疆鼠疫菌株多位点可变数目串联重复序列基因分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(6): 666-671.
[3]	郭秀霞, 程鹏, 刘丽娟, 王海防, 张崇星, 王怀位, 公茂庆. 白纹伊蚊紫外光敏感视蛋白基因的克隆及序列特征[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(5): 553-559.
[4]	母群征, 李欣颖, 刘蓉蓉, 杨军, 栗冬梅, 鲁亮, 李贵昌, 侯咏, 李明, 宋秀平, 孟凤霞, 刘起勇. 黑龙江省黑河市部分地区啮齿动物体表寄生恙螨调查[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(5): 570-575.
[5]	王卓, 吴琼, 金美松, 邢悦鹏, 杨义军, 吴益民. 中国长白山地区啮齿动物巴尔通体感染调查及基因型分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(5): 594-598.
[6]	栗冬梅, 徐爱玲, 宋秀平, 李庆多, 康央, 刘起勇. 巴尔通体在自然感染的啮齿动物组织中的分布[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2021, 32(2): 181-187.
[7]	贵有军, 王诚, 罗勇军, 阿布力克木·阿布都热西提, 王启果, 林军健, 卡斯木江·玉素甫, 李博, 雒涛. 准噶尔盆地北缘梭梭林区啮齿动物种群调查[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(6): 680-684.
[8]	杨瑞军, 黄世腾, 吕磊, 曹国平, 游佳玲, 万圣. 浙江省衢州市2019年本地登革热暴发疫情的分子流行病学研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(5): 521-525.
[9]	胡挺松, 胡秋凌, 李绍雄, 黄勇, 胡海梅, 高丽芬, 罗琼梅, 何永芝, 周永存, 张海林, 张富强. 云南省楚雄市2015-2018年肾综合征出血热流行特征及宿主动物调查[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2020, 31(2): 152-157.
[10]	李晔, 蓝玉清, 柳付明, 潘孝猛. 中国啮齿目动物体表寄生蜱种类与地理分布回顾[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(6): 682-688.
[11]	魏怀波, 杨喜凤, 赵亚飞, 刘佳琪, 邬婧, 田丽, 吴秀兰, 乔舜. 内蒙古边境口岸地区啮齿动物种类及区系分布[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(6): 703-706.
[12]	郭丽民, 席进孝, 盖永志, 吴斌, 王世明, 苗克军, 穆洮霞, 徐大琴. 甘肃省鼠疫疫源地啮齿动物DNA条形码分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(2): 176-179.
[13]	栗冬梅, 徐兆楠, 朱彩英, 张政, 康央, 张洪江, 宋秀平, 唐承军, 葛军旗. 应用TaqMan探针实时荧光定量PCR法调查北京市部分城郊区鼠传病原体流行状况[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(1): 12-17.
[14]	王博, 毛玲玲, 王子江, 李鑫, 于维君, 宋歌, 王周超, 孙英伟. 辽宁省2017年5例输入性卵形疟疾的实验室诊断[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2019, 30(1): 80-83.
[15]	张琳, 苗广青, 侯学霞, 李博, 郝琴. 巢式PCR和实时荧光定量PCR在莱姆病宿主动物监测中的应用评价[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2018, 29(5): 425-427.

鼠类感染淋巴细胞脉络丛脑膜炎病毒的RT-PCR检测与N基因序列分析

RT-PCR detection and N gene sequence analysis of Lymphocytic choriomeningitis virus in rodents

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