云南省澜沧江流域蚊虫流行性乙型脑炎病毒分子特征分析

中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2012, Vol. 23 ›› Issue (5): 391-394.

• 专题报道——虫媒病毒调查研究 • 上一篇下一篇

云南省澜沧江流域蚊虫流行性乙型脑炎病毒分子特征分析

郭晓芳^1,2, 王丕玉², 曾旭灿², 赵秋敏¹, 周传玲³, 龚道方³, 李佳³, 王海波³, 董利民², 周红宁², 张久松¹

1. 军事医学科学院微生物流行病研究所, 北京 100071;
2. 云南省寄生虫病防治所, 云南普洱 665000;
3. 大理学院病原与媒介生物研究所(普洱分部)

收稿日期:2012-07-09 出版日期:2012-10-20 发布日期:2012-10-20
通讯作者: 张久松,Email: zhang_jiusong@yahoo.com.cn;周红宁,Email: zhhn@yipd.org
基金资助:
国家自然科学基金(30660160)

Analysis of molecular characteristics of Japanese encephalitis virus isolatedfrom mosquitoes in Lancang River watershed in Yunnan province, China

GUO Xiao-fang^1,2, WANG Pi-yu², ZENG Xu-can², ZHAO Qiu-min¹, ZHOU Chuan-ling³, GONG Dao-fang³, LI Jia³, WANG Hai-bo³, DONG Li-min², ZHOU Hong-ning², ZHANG Jiu-song¹

1. Institute of Microbiology and Epidemiology, Academy of Military Medical Sciences, Beijing 100071, China;
2. Yunnan Institute ofParasitic Diseases, Pu’er 665000, Yunnan Province, China;
3. Institute of Pathogens and Vectors, Dali University(Puer Division)

Received:2012-07-09 Online:2012-10-20 Published:2012-10-20
Supported by:
Supported by the National Natural Science Foundation of China(No. 30660160)

摘要/Abstract

摘要：

目的确定2007-2009年从云南省澜沧江流域采集蚊虫中分离的13株流行性乙型脑炎病毒(JEV)基因型及其E基因序列特征。方法用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增E蛋白核苷酸序列,测序后用DNAStar软件包中的MegAlign程序完成核苷酸相似性和氨基酸同源性分析;用ClustalX1.83软件进行碱基配对后采用Mega5.0软件做进化树分析。结果 13株JEVE基因的核苷酸相似性为98.0%～100%,氨基酸的同源性为99.8%～100%,与我国乙脑减毒活疫苗株SA14-14-2的核苷酸相似性为86.1%～86.9%,氨基酸同源性为96.8%～97.2%;进化树分析发现,13株JEV均属于基因Ⅰ型。结论 2007-2009年从云南省澜沧江流域采集蚊虫中分离的13株病毒属于JEV基因Ⅰ型。

关键词: 澜沧江流域, 流行性乙型脑炎病毒, 基因Ⅰ型

Abstract:

Objective To analyze the genotypes and E gene sequence characteristics of 13 Japanese encephalitis virus(JEV) strains isolated from mosquitoes in Lancang River watershed in Yunnan province, China during 2007-2009. Methods E genes of 13 JEV strains were amplified by RT-PCR. The nucleotide similarity and amino acid homology were analyzed by MegAlign program in DNAStar software. Multiple sequence alignment and phylogenetic analysis were carried out using Clustal X 1.83 and the Mega 5.0. Results The nucleotide similarity and amino acid homology among the 13 JEV strains were 98.0%-100% and 99.8%-100% , respectively. Compared with the live attenuated vaccine strain (SA-14-14-2), the 13 JEV strains showed nucleotide similarity and amino acid homology of 86.1%-86.9% and 96.8%-97.2%, respectively. Phylogenetic analysis showed that the 13 JEV strains were genotypeⅠ. Conclusion The 13 JEV strains isolated from mosquitoes in Lancang River watershed in Yunnan province, China during 2007-2009 belonged to genotypeⅠ.

Key words: Lancang River watershed, Japanese encephalitis virus, GenotypeⅠ

中图分类号:

郭晓芳, 王丕玉, 曾旭灿, 赵秋敏, 周传玲, 龚道方, 李佳, 王海波, 董利民, 周红宁, 张久松. 云南省澜沧江流域蚊虫流行性乙型脑炎病毒分子特征分析[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2012, 23(5): 391-394.

GUO Xiao-fang, WANG Pi-yu, ZENG Xu-can, ZHAO Qiu-min, ZHOU Chuan-ling, GONG Dao-fang, LI Jia, WANG Hai-bo, DONG Li-min, ZHOU Hong-ning, ZHANG Jiu-song. Analysis of molecular characteristics of Japanese encephalitis virus isolatedfrom mosquitoes in Lancang River watershed in Yunnan province, China[J]. Chines Journal of Vector Biology and Control, 2012, 23(5): 391-394.

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云南省澜沧江流域蚊虫流行性乙型脑炎病毒分子特征分析

Analysis of molecular characteristics of Japanese encephalitis virus isolatedfrom mosquitoes in Lancang River watershed in Yunnan province, China

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