应用微卫星DNA标志研究我国大劣按蚊群体的遗传差异

中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2010, Vol. 21 ›› Issue (2): 98-101.

应用微卫星DNA标志研究我国大劣按蚊群体的遗传差异

王冬1，马雅军1，周红宁2

1 第二军医大学病原生物学教研室（上海 200433）； 2 云南省寄生虫病防治研究所

收稿日期:2009-11-17 出版日期:2010-04-20 发布日期:2010-04-20
通讯作者: 马雅军，Email: yajunm@yahoo.com.cn
作者简介:王冬（1980-），男，硕士，现工作单位为解放军309医院检验科。
基金资助:
国家自然科学基金委员会-云南省人民政府联合基金（U0932604）

Study on the genetic differences among Anopheles dirus sensu lato (Diptera: Culicidae) in China using microsatellite DNA markers

WANG Dong, MA Ya-Jun, ZHOU Hong-Ning

1 Department of Pathogen Biology, Second Military Medical University, Shanghai 200433, China; 2 Institute of Parasitic Disease Control of Yunnan Province

Received:2009-11-17 Online:2010-04-20 Published:2010-04-20
Contact: MA Ya?jun, Email: yajunm@yahoo.com.cn
Supported by:
Supported by the National Natural Science Foundation of China?Yunnan Jiont Fund （No. U0932604）

摘要/Abstract

摘要：

目的　应用微卫星DNA分子标志阐明我国大劣按蚊（广义）群体的遗传差异水平。方法　研究样本包括经分子鉴别的大劣按蚊（海南省实验室品系和海南省毛阳野生群体）和大劣按蚊D种（云南省江城和云南省勐腊野生群体），扩增10个多态的微卫星DNA位点，用Arlequin软件分析和计算相关指标。结果　对89个大劣按蚊样本进行微卫星位点的扩增，等位基因数范围为1～32个，平均值为3.60～25.20，并非所有微卫星位点在所有群体中均呈现多态性。群体的平均期望杂合度和观察杂合度的范围分别为0.49～0.72和0.36～0.58，两者在海南省群体中均为最低。成对群体间的FST值为负值或很小，提示群体间未出现遗传分化。分级AMOVA计算结果显示，大劣按蚊群体内的变异占总变异的103.29%，种内变异为负值（-3.97%），种间变异仅占总变异的0.67%。结论　大劣按蚊与大劣按蚊D种内和种间遗传差异均非常小，微卫星DNA的变异主要在个体间。

关键词: 大劣按蚊（广义）, 微卫星DNA, 群体遗传差异

Abstract:

Objective　Microsatellite DNA molecular markers were used in the present study to identify the genetic diversity of Anopheles dirus sensu lato in China. Methods　Molecularly identified, An. dirus (laboratory strains in Hainan province and wild population from Maoyang, Hainan) and species D of An. dirus (wild populations from Jiangcheng and Mengla, Yunnan province) constituted the samples, of which ten polymorphic microsatellite DNA loci were amplified and calculation of relevant index were performed using Arlequin software. Results　The amplification of microsatellite loci for 89 samples of An. dirus s.l. revealed a range of alleles from 1 to 32, with an average of 3.60-25.20. Not all microsatellite loci in each populations demonstrated polymorphism. The average expected heterozygosity and the observed heterozygosity were 0.49-0.72 and 0.36-0.58, respectively, being the lowest in Hainan province. The FST value between paired populations was negative or very small, suggesting that genetic differentiation did not occur among the populations. Hierarchical AMOVA calculations showed that the intrapopulatim variation of An. dirus s.l. amounted to 103.29% of the total variation, the intraspecific variation negative (-3.97%), and the interspecific variation accounted for only 0.67% of the total variance. Conclusion　The intra- and interspecific genetic differences of An. dirus s.s. and An. dirus species D were trivial, microsatellite DNA variations mostly present in individuals.

Key words: Anopheles dirus (sensu lato), Microsatellite DNA, Population genetic differences

中图分类号:

R384.1

王冬1，马雅军1，周红宁2. 应用微卫星DNA标志研究我国大劣按蚊群体的遗传差异[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2010, 21(2): 98-101.

WANG Dong, MA Ya-Jun, ZHOU Hong-Ning. Study on the genetic differences among Anopheles dirus sensu lato (Diptera: Culicidae) in China using microsatellite DNA markers[J]. Chines Journal of Vector Biology and Control, 2010, 21(2): 98-101.

参考文献

［1］ Sallum MAM, Peyton EL, Wilkerson RC. Six new species of the Anopheles leucosphyrus group, reinterpretation of the An. elegans and vector implications ［J］. Med Vet Entomol，2005，19（2）：158-199.
［2］ Obsomer V, Defourny P, Coosemans M. The Anopheles dirus complex:spatial distribution and environmental drivers［J］. Malar J，2007，6（6）：26-41.
［3］瞿逢伊. 我国大劣按蚊的分类地位与传疟作用研究现状［J］. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志，1998，16（3）：230-233.
［4］ Prakash A, Bhattacharyya DR, Mohapatra PK, et al. Malaria transmission risk by the mosquito Anopheles baimaii （formerly known as An. dirus species D） at different hours of the night in North?east India［J］. Med Vet Entomol，2005，19（4）：423-427.
［5］ Walton C, Handley JM, Collins FH, et al. Genetic population structure and introgression in Anopheles dirus mosquitoes in Southeast Asia ［J］. Mol Ecol，2001，10（3）：569-580.
［6］ Walton C, Handley JM, Tun?Lin W, et al. Population structure and population history of Anopheles dirus mosquitoes in Southeast Asia ［J］. Mol Biol Evol，2000，17（6）：962-974.
［7］周红宁，卢勇荣，朱国君，等. 云南大劣按蚊生态习性、地理分布和传疟作用研究［J］. 中国媒介生物学及控制杂志，1998，9（6）： 455-459.
［8］王冬，马雅军，周红宁. 应用mtDNA?COI基因序列研究我国大劣按蚊A、D群体的遗传差异［J］. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志， 2007，25（5）：368-371.
［9］余泉友，李斌，李关荣，等. 蚊虫全基因组中微卫星的丰度及其分布［J］. 生物化学与生物物理进展，2005，32（5）：435-441.
［10］樊勇，马雅军. 应用微卫星DNA技术研究蚊虫群体遗传的现状［J］. 国外医学寄生虫病分册，2005，32（6）：262-264.
［11］陆宝麟. 中国动物志. 昆虫纲. 9卷. 双翅目：蚊科（下卷）［M］. 北京：科学出版社，1997：77-80.
［12］ Collins FH, Mendez MA, Rasmussen MO, et al. A ribosomal RNA gene probe differentiates member species of the Anopheles gambiae complex［J］. Am J Trop Med Hyg，1987，37（1）：37-41.
［13］ Xu XC, Xu JN, Qu FY. A diagnostic polymerase chain reaction assay for species A and D of the Anopheles dirus （Diptera： Culicidae） species complex based on ribosomal DNA second internal transcribed spacer sequence［J］. J Am Mosq Control Assoc，1998，14（4）：385- 389.
［14］ Walton C, Handley JM, Harbach RE, et al. The Isolation and characterization of microsatellites from Anopheles dirus mosquitoes ［J］. Mol Ecol，2000，9（10）：1661-1686.
［15］ Kamau L, Mukabana WR, Hawley WA, et al. Analysis of genetic variability in Anopheles arabiensis and Anopheles gambiae using microsatellite loci［J］. Insect Mol Biol，1999，8（2）：287-297.
［16］ Donnelly MJ, Cuamba N, Charlwood JD, et al. Population structure in the malaria vector， Anopheles arabiensis Patton, in East Africa［J］. Heredity，1999，83（4）：408-417.
［17］闫路娜，张德兴. 种群微卫星DNA分析中样本量对各种遗传多样性度量指标的影响［J］. 动物学报，2004，50（2）：279-290.
［18］ Stohler RA, Curti J, Minchella DJ. A comparison of microsatellite polymorphism and heterozygosity among field and laboratory populations of Schistosoma mansoni［J］. Int J Parastol，2004，34（5）： 595-601.
［19］ Xu JN, Qu FY. Ribosomal DNA difference between species A and D of the Anopheles dirus complex of mosquitoes from China［J］. Med Vet Entomol，1997，11（2）：134-138.
［20］ Walton C, Handley JM, Kuvangkadilok C, et al. Identification of five species of the Anopheles dirus from Thailand， using allele?specific polymerase chain reaction［J］. Med Vet Entomol，1999，13（1）： 24-32.
［21］ Temu EA, Hunt RH, Coetzee M. Microsatellite DNA polymorphism and heterozygosity in the malaria vector mosquito Anopheles funestus （Diptera： Culicidae） in East and Southern Africa［J］. Acta Trop， 2004，90（1）：39-49.