应用逆转录聚合酶链反应和序列分析对褐家鼠肺汉坦病毒进行分型研究

中国媒介生物学及控制杂志

应用逆转录聚合酶链反应和序列分析对褐家鼠肺汉坦病毒进行分型研究

张永华; 陈化新

中国预防医学科学院流行病学微生物学研究所北京102206

出版日期:1997-10-20 发布日期:1997-10-20

Typing of Hantavirus from Lung Tissues of R. norvegicus by Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction and Sequence Analysis

Zhang Yong-hua; Chen Hua-xin

Institute of Epidemiology and Microbiology.Chinese Academy of Preventive Medicine,Beijing,102206

Online:1997-10-20 Published:1997-10-20

摘要/Abstract

摘要： 对来自北京西客站附近一集装箱仓库的2份汉坦病毒免疫荧光抗原阳性褐家鼠肺组织进行分型研究。方法；采用逆转录聚合酶链反应（RT．PCR）和序列分析。结果：这两份褐家鼠肺标本均携带汉城型（SEO）汉坦病毒（HV）。RT－PCR扩增其中1份标本所携带病毒的M基因330bp片段，通过pGEM－T载体克隆进入大肠杆菌JM109，并进行核着酸序列测定，经与其它HV核着酸序列的同源性比较，其与SEO型毒株相应片段核着酸序列的同源性在93.9％～96.4％之间，而与其它血清型毒株的同源性在61.5％～75.8％之间。结论：首次证实北京地区宿主动物携带SEO型HV.

关键词: 汉坦病毒, 逆转录聚合酶链反应, 序列分析

Abstract: The purpose of thls study was to type 2 strains of hantavirus frorn antigen positive lung tissues of R.norvegicus captured in a container Pool near Beijing railway station.Reverse transcriptionpolyrnerase chain reaction (RT-PCR) showed that the 2 samples carried hantaviruses of SEO serotype.330 base pair region of the medium (M) genome segment of hantavirus was amplified directly frorn one of the antigen positive rat lungs by RT-PCR and cloned into E.coli JM109 by using plasmid vector pGEM-T.The genomic fragment was sequenced and compared with those of other well characterized hantaviruses.The comparison of the sarnple to SEO virus isolates revealed 93.9% to 96.4% homology and displayed 61.5% to 75.8% homology when compared with other serotypes of hantavirus.The existence of SEO virus in host animals in Beijing was verified for the first time.

张永华; 陈化新. 应用逆转录聚合酶链反应和序列分析对褐家鼠肺汉坦病毒进行分型研究[J]. 中国媒介生物学及控制杂志.

Zhang Yong-hua; Chen Hua-xin. Typing of Hantavirus from Lung Tissues of R. norvegicus by Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction and Sequence Analysis[J]. Chines Journal of Vector Biology and Control.

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