DNA条形码技术在中国-哈萨克斯坦边境阿拉山口地区鼠类鉴定中的应用

doi:10.11853/j.issn.1003.8280.2016.05.009

中国媒介生物学及控制杂志 ›› 2016, Vol. 27 ›› Issue (5): 459-462.DOI: 10.11853/j.issn.1003.8280.2016.05.009

DNA条形码技术在中国-哈萨克斯坦边境阿拉山口地区鼠类鉴定中的应用

王安东^1,2, 尹小平², 田延河², 梁臻², 巴特², 张江国²

1 新疆石河子大学动物科技学院, 新疆石河子 832000;
2 阿拉山口出入境检验检疫局, 新疆博乐 833418

收稿日期:2016-04-15 出版日期:2016-10-20 发布日期:2016-10-20
通讯作者: 尹小平,Email:yxpciq@163.com
作者简介:王安东,男,在读硕士,主要从事兽医卫生监督与管理研究,Email:wadshzu@163.com
基金资助:
国家质检总局科技计划项目（2016IK264）

Application of DNA barcoding in classification of rodents at Alataw pass, China-Kazakhstan

WANG An-dong^1,2, YIN Xiao-ping², TIAN Yan-he², LIANG Zhen², BA Te², ZHANG Jiang-guo²

1 College of Animal Science and Technology, Shihezi University, Shihezi 832000, Xinjiang Uygur Autonomous Region, China;
2 Alashankou Entry-Exit Inspection and Quarantine Authority of the PRC

Received:2016-04-15 Online:2016-10-20 Published:2016-10-20
Supported by:
Supported by the General Administration of Quality Supervision, Inspection and Quarantine of the People's Republic of China Scientific Research Subject (No. 2016IK264)

摘要/Abstract

摘要：

目的以中国-哈萨克斯坦边境（中哈边境）阿拉山口地区常见鼠种为研究对象，使用线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ（COⅠ）和细胞色素b（Cytb）基因，利用DNA条形码技术鉴定鼠种。方法 2013－2014年在中哈边境阿拉山口地区采集鼠类样本，形态学鉴定完毕后提取鼠肝脏DNA，用PCR方法扩增线粒体COⅠ和 Cytb基因，进行测序及Blast分析，使用Mega 6.0软件构建分子进化树。结果共采集鼠类样本4属7种382只，COⅠ和Cytb 基因鉴定与形态学鉴定结果相符。结论 DNA条形码技术可对鼠类进行有效的鉴定，为口岸快速准确地识别宿主及监控外来医学媒介生物提供了科学依据。

关键词: DNA条形码, 中国-哈萨克斯坦边境, 种类鉴定, 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ, 细胞色素b

Abstract:

Objective To evaluate the cytochrome C oxidase subunit Ⅰ(COⅠ) and cytochrome b (Cytb) gene as the DNA barcodes for identifying the rodent species in the Alataw pass, China-Kazakhatan. Methods The genome DNA were extracted from rodent samples of 7 species collected from Alataw pass, China-Kazakhatan during the 2013-2014. The mitochondrial COⅠand Cytb genes was amplified by PCR and sequenced. The phylogenetic trees were constructed by Mega 6.0 based on the nucleotide sequences of rodents published in the GenBank and the homology was analyzed. Results The 382 rodent samples of 7 species were clustered into 4 genera during the 2013-2014. The identification of COⅠ and Cytb gene results were 100% matched with the morphological analysis. Conclusion DNA barcoding can be used to effectively identify rodent species. DNA barcode technology provides a quick and accurate tool to identify the pathogen hosts and exotic medical vectors.

Key words: DNA barcode, China-Kazakhstan, Species identification, Cytochrome C oxidase subunitⅠ, Cytochrome b

中图分类号:

S443

王安东, 尹小平, 田延河, 梁臻, 巴特, 张江国. DNA条形码技术在中国-哈萨克斯坦边境阿拉山口地区鼠类鉴定中的应用[J]. 中国媒介生物学及控制杂志, 2016, 27(5): 459-462.

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DNA条形码技术在中国-哈萨克斯坦边境阿拉山口地区鼠类鉴定中的应用

Application of DNA barcoding in classification of rodents at Alataw pass, China-Kazakhstan

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