1 材料与方法
1.1 样本采集
1.2 实验室检测
1.2.1 样品前处理与核酸制备
1.2.2 实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)
1.2.3 普通PCR及测序
表1 巴尔通体检测引物/探针序列Tab. 1 Primer sequences for Bartonella detection |
| 方法 | 基因名称 | 引物/探针名称 | 引物序列(5'-3') | 目的片段长度(bp) |
| 实时荧光定量PCR | ssrA[9] | ssrA-F | GCTATGGTAATAAATGGACAATGAAATAA | |
| ssrA-R | GCTTCTGTTGCCAGGTG | - | ||
| ssrA-T | HEX-ACCCCGCTTAAACCTGCGACG-BHQ-1 | |||
| PCR | gltA[9] | Bart-1 | GTATGTGCTTTTCTGTTCCTTGTG | 566 |
| Bart-2 | GCTAATGCAAATAGAACAGTAAAC |
注:- 实时荧光定量PCR不检测目的片段长度,无此数据。 |
1.3 序列分析
1.4 统计学分析
2 结果
2.1 鼠类捕获情况
表2 2024年内蒙古自治区10个盟(市)捕获鼠种类及密度Tab. 2 Rodent species and density captured in ten leagues (cities) of Inner Mongolia Autonomous Region, 2024 |
| 地区 | 捕获数量(只) | 鼠密度(%) | 鼠种构成比(%) | |||||||||
| 小家鼠 | 褐家鼠 | 长爪沙鼠 | 达乌尔黄鼠 | 五趾跳鼠 | 大沙鼠 | 黑线姬鼠 | 阿拉善黄鼠 | 北社鼠 | 布氏田鼠 | |||
| 东部地区 | ||||||||||||
| 兴安盟 | 60 | 1.68 | 26.67 | 66.67 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 6.66 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| 通辽市 | 120 | 3.72 | 2.50 | 75.83 | 0.00 | 21.67 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| 赤峰市 | 70 | 2.36 | 38.57 | 54.29 | 0.00 | 5.71 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 1.43 | 0.00 |
| 中部地区 | ||||||||||||
| 呼和浩特市 | 65 | 2.21 | 56.92 | 43.08 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| 锡林郭勒盟 | 91 | 7.26 | 24.18 | 48.35 | 2.20 | 16.48 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 8.79 |
| 乌兰察布市 | 61 | 6.70 | 16.39 | 8.20 | 75.41 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| 西部地区 | ||||||||||||
| 包头市 | 60 | 3.49 | 1.67 | 1.67 | 58.33 | 25.00 | 5.00 | 5.00 | 0.00 | 3.33 | 0.00 | 0.00 |
| 鄂尔多斯市 | 60 | 3.26 | 58.33 | 20.00 | 3.33 | 3.33 | 15.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| 巴彦淖尔市 | 60 | 4.52 | 71.67 | 21.67 | 6.66 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| 乌海市 | 51 | 4.25 | 0.00 | 0.00 | 100.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 |
| 合计 | 698 | 3.33 | 27.79 | 38.97 | 20.06 | 8.88 | 1.72 | 0.43 | 0.57 | 0.29 | 0.14 | 1.15 |
2.2 qPCR结果及巴尔通体阳性率
表3 2024年内蒙古自治区鼠类巴尔通体实时荧光定量PCR检测阳性率地区分布Tab. 3 Regional distribution of qPCR-detection positive rate of Bartonella of rodents in Inner Mongolia Autonomous Region, 2024 |
| 地区 | 检测数(只) | 阳性数(只) | 阳性率(%) |
| 东部地区 | |||
| 兴安盟 | 60 | 0 | 0.00 |
| 通辽市 | 120 | 1 | 0.83 |
| 赤峰市 | 70 | 0 | 0.00 |
| 小计 | 250 | 1 | 0.40 |
| 中部地区 | |||
| 呼和浩特市 | 65 | 2 | 3.03 |
| 锡林郭勒盟 | 91 | 5 | 5.49 |
| 乌兰察布市 | 61 | 8 | 13.11 |
| 小计 | 217 | 15 | 6.91 |
| 西部地区 | |||
| 包头市 | 60 | 0 | 0.00 |
| 鄂尔多斯市 | 60 | 1 | 1.67 |
| 巴彦淖尔市 | 60 | 1 | 1.67 |
| 乌海市 | 51 | 9 | 17.65 |
| 小计 | 231 | 11 | 4.76 |
| 合计 | 698 | 27 | 3.87 |
2.3 不同鼠种巴尔通体阳性率
表4 2024年内蒙古自治区鼠类巴尔通体实时荧光定量PCR检测种间阳性率Tab. 4 Bartonella infection rates by qPCR across various rodent hosts in Inner Mongolia Autonomous Region, 2024 |
| 鼠种 | 数量(只) | 构成比(%) | 阳性数(只) | 阳性率(%) |
| 褐家鼠 | 272 | 38.97 | 3 | 1.10 |
| 小家鼠 | 194 | 27.79 | 1 | 0.52 |
| 长爪沙鼠 | 140 | 20.06 | 17 | 12.14 |
| 其他鼠种 | 92 | 13.18 | 6 | 6.52 |
| 合计 | 698 | 100.00 | 27 | 3.87 |
2.4 不同生境及性别鼠巴尔通体阳性率
表5 2024年内蒙古自治区不同生境鼠巴尔通体实时荧光定量PCR检测阳性率Tab. 5 Bartonella infection rates of rodents by qPCR across various habitats in Inner Mongolia Autonomous Region, 2024 |
| 生境 | 检测数(只) | 阳性数(只) | 阳性率(%) |
| 农村居民区 | 360 | 8 | 2.22 |
| 城镇居民区 | 131 | 2 | 1.53 |
| 草原 | 61 | 6 | 9.84 |
| 重点行业 | 45 | 2 | 4.44 |
| 荒漠/半荒漠 | 44 | 8 | 18.18 |
| 农田耕地 | 12 | 1 | 8.33 |
| 其他生境 | 45 | 0 | 0.00 |
| 合计 | 698 | 27 | 3.87 |
注:重点行业包括餐饮、食品制售、建筑工地、屠宰场、酿造厂等;其他生境包括灌丛、丘陵、林地、公园。 |