%0 Journal Article
%A 郭玉红
%A 刘蓬勃
%A 刘起勇
%A 鲁亮
%A 宋秀平
%A 孙琬琬
%A 王君
%T 滇西南地区埃及伊蚊种群微卫星标记筛选研究
%D 2018
%R 10.11853/j.issn.1003.8280.2018.02.004
%J 中国媒介生物学及控制杂志
%P 130-133
%V 29
%N 2
%X 目的 研究滇西南地区埃及伊蚊种群遗传学特征,针对该地区的埃及伊蚊种群筛选新的微卫星位点。方法 从美国国立生物技术信息中心GenBank数据库中下载埃及伊蚊全基因组数据,利用Tandem Repeats Finder软件查找全基因组中的微卫星位点,选择重复单位为2~4 bp且重复次数< 30的微卫星位点,对其侧链进行BLAST比对,选择在基因组中单拷贝的位点设计引物,再对引物进行BLAST比对,选择扩增产物为单拷贝的引物进行相关筛选。结果 从17个全基因组中共获得80条微卫星序列,并成功设计出11对多态性引物,核心序列包括5对2碱基重复,5对3碱基重复以及1对4碱基重复,共有98个等位基因,平均每对引物有9个等位基因,观察杂合度平均值为(0.394±0.026)。结论 设计引物可稳定地扩增出目标条带,且多态性较高,可以用于埃及伊蚊的种群遗传学研究。
%U http://www.bmsw.net.cn/CN/10.11853/j.issn.1003.8280.2018.02.004